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该项目从父系和母系遗传角度对柴达木黄牛的分子遗传多样性、群体遗传结构、遗传分化、系统发育关系、起源及与中国北方黄牛品种/群体间的亲缘关系等进行了较为系统地研究，并制定了初步的保种和选育方案，为今后开展柴达木黄牛的种质资源保护与选育奠定了良好基础。研究表明柴达木黄牛具有丰富的母系遗传多样性，拥有普通牛和瘤牛2个母系起源，但其父系遗传多样性较低，由2个普通牛父系支系组成，具有普通牛父系起源。发现柴达木黄牛与蒙古牛、秦川牛、安西牛等品种/群体具有较近的亲缘关系，与蒙古牛、秦川牛亲缘关系最近；柴达木黄牛群体间分化程度水平较高，5个群体（即格尔木、都兰、乌兰、大柴旦和茫崖群体）可聚为2类，其聚类结果反映了各群体间的亲缘关系。该项目在执行期间共发表论文4篇，其中SCI收录2篇，中文核心期刊论文2篇；授权实用新型专利1件。成果研究水平达到国际先进水平。